ABSTRACT
Este trabalho versa sobre potencialidades e limites relacionados à utilização de processamentos de dados para auxiliar na produção e sistematização de conhecimento científico. Objetiva, através de um exercício experimental envolvendo a utilização de algoritmo, discutir a viabilidade do uso de técnicas de coleta automatizada para levantamento e produção de dados utilizáveis no âmbito das pesquisas científicas. Como demonstração, busca reproduzir de maneira automatizada processos relacionados à coleta de dados de pesquisa anteriormente publicada neste periódico, descrevendo metodologicamente como foram organizados e desenvolvidos a extração e o tratamento desses dados. Como resultado, constata que o processamento automatizado pode ser uma alternativa produtiva e eficiente para auxiliar nas sistematizações e análises sobre o acumulado crescente de publicações no campo científico, podendo abrir novos caminhos metodológicos de pesquisa na Educação Física, especialmente considerando o volume de dados passível de coleta e análise em redes sociais, fóruns e outras plataformas na web. (AU)
This paper deals with potentials and limits related to the use of data processing to assist in the production and systematization of scientific knowledge. It aims, through an experimental exercise involving the use of an algorithm, to discuss the feasibility of using automated collection techniques for surveying and producing data that can be used in scientific research. As a demonstration, it seeks to automatically reproduce processes related to the collection of research data previously published in this journal, describing methodologically how the extraction and treatment of these data was organized and developed. As a result, it finds that automated processing can be a productive and efficient alternative to assist in the systematization and analysis of the growing accumulation of publications in the scientific field, which may open new methodological paths for research in Physical Education, especially considering the volume of data subject to collection and analysis on social networks, forums and other web platforms. (AU)
Este trabajo aborda las potencialidades y los límites relacionados con el uso del procesamiento de datos para ayudar en la producción y sistematización del conocimiento científico. Su objetivo, a través de un ejercicio experimental que implica el uso de un algoritmo, es discutir la viabilidad del uso de técnicas de recolección automatizada para la obtención y producción de datos que se puedan utilizar en el ámbito de las investigaciones científicas. A modo de demostración, se busca reproducir de manera automatizada procesos relacionados con la recolección de datos de una investigación previamente publicada en esta revista, describiendo metodológicamente cómo se organizó y desarrolló la extracción y el tratamiento de esos datos. Como resultado, se constata que el procesamiento automatizado puede ser una alternativa productiva y eficiente para ayudar en la sistematización y análisis de la creciente acumulación de publicaciones en el campo científico, lo que puede abrir nuevos caminos metodológicos para la investigación en Educación Física, especialmente considerando el volumen de datos que se pueden recolectar y analizar en redes sociales, foros y otras plataformas web. (AU)
Subject(s)
Humans , Male , Female , Electronic Data Processing , Bibliometrics , Information Storage and RetrievalABSTRACT
RESUMO: Objetivo: Estimar o grau de concordância e validade dos diagnósticos de neoplasias malignas relacionadas à exposição ao asbesto registrados no Sistema de Informação Hospitalar do Sistema Único de Saúde (SIH/SUS), em comparação aos Registros Hospitalares de Câncer do Estado de São Paulo (RHC/SP). Métodos: Óbitos com registros de neoplasias malignas associadas ao asbesto foram identificados e extraídos do SIH/SUS entre 2007 e 2014. Óbitos nos casos de câncer registrados na base do RHC/SP foram extraídos para o mesmo período. Essas bases foram unidas pelos mesmos indivíduos empregando-se o software Link Plus. Um único diagnóstico codificado pela CID-O3 ou CID-10 selecionado de cada sistema foi analisado. A proporção de concordância e a sensibilidade, especificidade e valores preditivos foram estimados. Resultados: Encontraram-se 19.458 pares com registros nas duas bases. A proporção de concordância foi elevada, variando de 92,4% para a localização primária desconhecida a 99,7% para o câncer de pleura. O índice Kappa variou de 0,05 (IC95% 0,04 - 0,07) para o câncer de pleura a 0,85 (IC95% 0,84 - 0,87) para o câncer de pulmão. A menor sensibilidade foi de 0,08 (IC95% 0,01 - 0,25), para o câncer de pleura, e a maior de 0,90 (IC95% 0,90 - 0,91), para o câncer de pulmão. Conclusão: Diagnósticos de neoplasias malignas associadas ao asbesto alcançaram maiores níveis de concordância e validade quando comuns. Os diagnósticos mais raros apresentaram baixa acurácia no SIH/SUS.
ABSTRACT: Objective: To estimate the degree of agreement and validity of diagnoses of asbestos-related malignant neoplasms registered in the Hospital Information System of the Brazilian Unified Health System (SIH/SUS), in comparison to the Hospital Cancer Registries of the State of São Paulo (HCR/SP). Methods: Deaths with records of malignant neoplasms associated with asbestos were identified and extracted from SIH/SUS between 2007 and 2014. Deaths in cases registered in the HCR/SP were extracted for the same period. The databases were linked using software Link Plus. A single ICD-10-coded diagnosis selected from each system was analyzed. The proportion of agreement, and the sensitivity, specificity and predictive values were estimated. Results: 19,458 pairs were found with records in both bases. The proportion of agreement was high, ranging from 92.4% for the unknown primary site, to 99.7% for cancer of the pleura. The Kappa Index ranged from 0.05 (95%CI 0.04 - 0.07) for cancer of the pleura to 0.85 (95%CI 0.84 - 0.87) for lung cancer. Sensitivity varied from 0.08 (95%CI 0.01 - 0.25) for cancer of the pleura, to 0.90 (95%CI 0.90 - 0.91) for lung cancer. Conclusion: Diagnosis of asbestos-related malignancies reached higher levels of agreement and validity when common. Rare diagnoses showed low accuracy in SIH/SUS.
Subject(s)
Humans , Asbestos , Hospital Information Systems , Lung Neoplasms/diagnosis , Lung Neoplasms/etiology , Lung Neoplasms/epidemiology , Brazil/epidemiology , Databases, FactualABSTRACT
RESUMEN Los objetivos de este artículo son describir las características del abordaje de vinculación de bases de datos administrativos y sus usos en investigación en salud pública, y discutir las potencialidades y retos para su implementación en Ecuador. La vinculación de bases de datos permite integrar datos de una misma persona dispersos en distintos subsectores como salud, educación, justicia, inmigración y programas sociales, y posibilita investigaciones que informen una gestión más eficiente de programas y políticas sociales y de salud. Las principales ventajas del uso de bases de datos relacionadas son la diversidad de datos, la cobertura poblacional, la estabilidad temporal y el costo menor en comparación con la recolección de datos primarios. A pesar de la disponibilidad de herramientas para procesar, vincular y analizar grandes conjuntos de datos, el uso de este abordaje es mínimo en los países de América Latina. Ecuador tiene un alto potencial para explotar este abordaje, debido a la obligatoriedad del uso de un identificador único en la prestación de servicios de salud, que permite la vinculación con otros sistemas de información nacionales. Sin embargo, enfrenta una serie de retos técnicos, ético-legales, culturales y políticos. Para aprovechar su potencial, Ecuador necesita desarrollar una estrategia de gobernanza de datos que incluya normativas de acceso y uso de los datos, de manera simultánea con mecanismos de control y calidad de los datos, una mayor inversión en formación profesional en el uso de los datos dentro y fuera del sector salud, y colaboraciones entre entidades gubernamentales, universidades y organizaciones de la sociedad civil.
ABSTRACT The objective of this article is to describe the characteristics of addressing the linkage of administrative databases and the uses of such linkages in public health research, and also to discuss the opportunities and challenges for implementation in Ecuador. The linkage of databases makes it possible to integrate a person's data that may be scattered across different subsectors such as health, education, justice, immigration, and social programs. It also facilitates research that can inform more efficient management of social and health programs and policies. The main advantages of using linked databases are: diversity of data, population coverage, stability over time, and lower cost in comparison to primary data collection. Despite the availability of tools to process, link, and analyze large data sets, there has been minimal use of this approach in Latin American countries. Ecuador is well positioned to implement this approach, due to compulsory use of a unique ID in health services delivery, which permits linkages with other national information systems. However, the country faces several cultural, technical, ethical, legal, and political challenges. To take advantage of its potential, Ecuador needs to develop a data governance strategy that includes standards for data access and data use, as well as mechanisms for data control and quality, greater investment in professional training in data use both within and beyond the health sector, and collaborations between government entities, universities, and civil society organizations.
RESUMO Os objetivos deste artigo são descrever as características do método de vinculação de bancos de dados administrativos e sua utilização em pesquisa em saúde pública e examinar o potencial e os desafios para sua implementação no Equador. A vinculação de bancos de dados possibilita integrar dados de uma mesma pessoa dispersos em subsetores diversos como saúde, educação, justiça, imigração e programas sociais e realizar pesquisas para subsidiar a gestão mais eficiente de programas e políticas sociais e de saúde. Entre as principais vantagens de utilizar bancos de dados vinculados estão diversidade dos dados, cobertura populacional, estabilidade temporal e custo menor em comparação à coleta de dados primários. Apesar de existirem ferramentas para processar, vincular e analisar grandes conjuntos de dados, a utilização deste método é mínima nos países da América Latina. O Equador possui um grande potencial para beneficiar-se com este método devido à obrigatoriedade do uso de um identificador único na prestação de serviços de saúde, o que permite a vinculação com outros sistemas de informação nacionais, mas enfrenta uma série de desafios técnicos, éticos-legais, culturais e políticos. Para aproveitá-lo, o país precisa elaborar uma estratégia de governança de dados contendo um conjunto de normas para o acesso e a utilização simultâneos com mecanismos de controle e qualidade dos dados, maior investimento em formação profissional no uso dos dados dentro e fora da área da saúde e colaboração entre entidades governamentais, universidades e organizações da sociedade civil.
Subject(s)
Humans , Information Storage and Retrieval , Data Management , Medical Record Linkage , Databases, Factual , Delivery of Health Care , Public Health Informatics , EcuadorABSTRACT
Este artigo tem como base um estudo em que foram levantados e organizados termos do domínio da radiologia obstétrica e, então, foi identificado se os mesmos estão compreendidos em quatro distintos vocabulários controlados: OntoNeo, RadLex, LOINC e SNOMED. É apresentado o Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (STT/SC) e o projeto de estruturação de laudos de exames de radiologia obstétrica, bem como o contexto teórico da ciência da informação sobre vocabulários controlados.Foram realizadas uma pesquisa de campo para o levantamento dos termos junto a um especialista da área e uma pesquisa documental para o levantamento estatístico dos termos em vocabulários controlados.Constituiu-se uma hierarquia dos termos levantados e verificou-se a cobertura de cada um dos vocabulários controlados em relação aos termos. O SNOMED é o vocabulário controlado com maior potencial de uso para a indexação de laudos no domínio da radiologia obstétrica.(AU)
This article bases on a study in which terms of the obstetric radiology domain were collected and arranged, and then we identified whether they are comprised in four distinct controlled vocabularies: OntoNeo, RadLex, LOINC and SNOMED. We present the STT/SC Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (Santa Catarina's integrated system of telemedicine and tele health) and theproject of structuring diagnostic reports of tests in obstetric radiology, as well as the theoretical contextof information science about controlled vocabulary. We carried out a survey of the terms jointly an expertand a documentary research to the statistical survey of the terms from controlled vocabularies. A hierarchy of the terms collected was established and the coverage of each of the controlled vocabularies in relation to the terms was verified. The SNOMED is the controlled vocabulary with greater potential of use for theindexation of diagnostic reports in the field of obstetric radiology.
Este artículo se basa en un estudio en el cual fueron levantados y arreglados términos del dominio de la radiología obstétrica, y entonces fue identificado si los mismos están comprendidos en cuatro distintos vocabularios controlados: el OntoNeo, el RadLex, el LOINC y el SNOMED. Presentamos el STT/SC Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (sistema integrado catarinense de telemedicina y telesalud) y el proyecto de estructuración de resultados de exámenes de radiología obstétrica, así como el contexto teórico de la ciencia de la información sobre vocabularios controlados. Una investigación de campo fue realizada para el levantamiento de los términos junto a un especialista y una investigación documental para el levantamiento estadístico de los términos en vocabularios controlados. Se ha constituido una jerarquía de los términos levantados y se ha verificado la cobertura de cada uno de los vocabularios controlados en relación a los términos. El SNOMED es el vocabulario controlado con mayor potencial deuso para la indexación de los resultados de exámenes en el dominio de la radiología obstétrica.
Subject(s)
Humans , Information Systems/standards , Obstetrics , Radiography, Thoracic/classification , Telemedicine , Terminology as Topic , Vocabulary, Controlled , Health Information Exchange , Information Storage and RetrievalABSTRACT
Objetiva desenvolver um percurso metodológico para recuperar informações científicas sobre as Doenças Tropicais Negligenciadas (DTN) em bases de dados internacionais (Scopus, Web of Science e PubMed). Os procedimentos metodológicos desta pesquisa foram: a) identificação das principais doenças tropicais segundo a Organização Mundial da Saúde; b) padronização dos nomes das doenças a partir dos Descritores em Ciências da Saúde da Biblioteca Virtual de Saúde (DeCS/BVS); c) construção de duas listas: uma com os termos controlados associados a operadores booleanos, e outra com os termos não controlados, também estruturada com operadores booleanos; d) busca de informações nas principais bases de dados anteriormente citadas de maneira controlada e não controlada; e) comparação dos resultados obtidos entre a busca controlada e não controlada; f) construção de fluxo metodológico para fins de replicação. Percebeu-se que o uso da busca controlada aumentou a revocação do processo de recuperação da informação, especificamente, a Base Scopus apresentou um aumento mais significativo na recuperação de resultados (11,28 %). A PubMed teve um incremento na revocação de 8,92 % e a Web of Science de 2,64 %. Ademais, propõe-se neste trabalho um fluxo para a recuperação da informação nas referidas bases, que sirva para os pesquisadores neste tema, pois entende-se que o alto grau de variabilidade das palavras e a dispersão na representação do tema nas bases constitui-se no importante impeditivo para a recuperação de informações(AU)
El objetivo de esta investigación fue desarrollar una metodología para recuperar informaciones científicas sobre las enfermedades tropicales desatendidas, en bases de datos internacionales (Scopus, Web of Science y PubMed). Los procedimientos metodológicos de esta investigación fueron: a) identificación de las principales enfermedades tropicales según la Organización Mundial de la Salud; b) estandarización de los nombres de las enfermedades a partir de los Descriptores en Ciencias de la Salud de la Biblioteca Virtual de Salud (DeCS/BVS); c) construcción de dos listas: una con los términos controlados asociados a operadores booleanos, y otra con los términos no controlados, también estructurada con operadores booleanos; d) búsqueda de informaciones en las principales bases de datos anteriormente citadas de manera controlada y no controlada; e) comparación de los resultados obtenidos entre la búsqueda controlada y no controlada; f) construcción de flujo metodológico para fines de replicación. Se percibió que el uso de la búsqueda controlada aumentó la revocación del proceso de recuperación de la información. Específicamente la Base Scopus presentó un aumento más significativo en los resultados (11,28 %). PubMed tuvo un incremento en la revocación del 8,92 % y la Web of Science del 2,64 %. Además, se propone en este trabajo un flujo para la recuperación de la información en las referidas bases, que sirva para los investigadores en este tema, pues se entiende que el alto grado de variabilidad de las palabras y la dispersión en la representación del tema en las bases se constituyen en importante impedimento para la recuperación de informaciones(AU)
It aims to develop a methodological pathway for the retrieval of scientific information on neglected tropical diseases in international databases (Scopus, Web of Science and PubMed). The methodological procedures performed in this work were: a) identification of the main tropical diseases according to the World Health Organization; b) conversion of the names of the diseases in standardized terms from the Descriptors in Health Sciences of the Virtual Health Library (DeCS), c) the construction of two lists: one with the standard terms associated with Boolean operators, and the other with the nonstandard terms; d) search for information in the main databases previously mentioned in a standardized and non-standardized way; e) comparison of the results obtained between standardized and non-standardized search; f) methodological flow construction for replication purposes. As a main result it was observed that the use of the standardized search increased the recall of the information retrieval process, and Scopus was the basis that presented a more significant increase in the retrieval of results (11.28 %). PubMed had an increase in recall of 8.92 % and Web of Science of 2.64 %. In addition, it is proposed in this work a flow for the retrieval of the information in the mentioned bases, that can be useful to all the researchers who wish to obtain scientific information on this subject, since it is understood that the high degree of variability of the words and the dispersion in the representation of the theme in the bases constitutes the important impediment for the information retrieval(AU)
Subject(s)
Humans , Information Storage and Retrieval , Vocabulary, Controlled , Database , Neglected DiseasesABSTRACT
O Objetivo desse trabalho foi identificar e analisar as fontes de informação bibliográficas para pesquisa na área de saúde. Foram selecionadas cinco fontes de informação, sendo três de acesso livre: PubMed, LILACS e SciELO e duas de acesso controlado: Scopus e Web of Science identificadas e caracterizadas observando-se aspectos como número de revistas indexadas, conteúdo, frequência de atualizações entre outros. Em seguida, foram convidados 48 participantes, sendo 15 bibliotecários de e 33 usuários de duas instituições de pesquisa e duas universidades, todos profissionais da área da saúde que, após concordarem em participar da pesquisa e assinarem o termo de consentimento livre e esclarecido (TCLE), receberam um link, por e-mail, para preenchimento do questionário online onde avaliaram o grau de satisfação referente às cinco fontes de informação acima relacionadas. As palavras-chave para esta pesquisa foram AIDS, Acquired Immunodeficiency Syndrome, SIDA ou Síndrome da Imunodeficiência Adquirida e o período de pesquisa foi de 30 anos (1984 a 2014). A análise realizada mostrou que, a Web of Science, em comparação com as demais fontes de informação possui maior quantidade de citações disponíveis, a periodicidade de avaliação dos periódicos a serem incluídos é contínuo e apresentam ferramentas de análise de citações. Este recurso também está presente na Scopus e SciELO.
The objective of this work was to identify and analyze the bibliographicinformation sources for research in the health area. Five information sourceswere selected, three of which were free access: PubMed, LILACS andSciELO, and two of controlled access: Scopus and Web of Science identifiedand characterized by aspects such as number of journals indexed, content,frequency of updates and others. Next, 48 participants were invited, 15librarians and 33 users from two research institutions and two universities, allhealth professionals who, after agreeing to participate in the study andsigning the informed consent term (TCLE) , received a link, by e-mail, tocomplete the online questionnaire where they assessed the degree ofsatisfaction regarding the five information sources listed above. Thekeywords for this research were AIDS, Acquired ImmunodeficiencySyndrome, SIDA or Síndrome da Imunodeficiência Adquirida, and theresearch period was 30 years (1984 to 2014). The analysis showed that theWeb of Science, in comparison to the other information sources, has agreater number of citations available, the periodicity of evaluation of theperiodicals to be included is continuous and they present citation analysistools. This feature is also present in Scopus and SciELO. PubMed /MEDLINE and LILACS were the free access information sources that haveaccess to controlled vocabularies with descriptors in health science (MedicalSubject Headings [MeSH] and Descritores em Ciências da Saúde [DeCS],respectively). Controlled access sources do not have direct access tocontrolled vocabularies, since their contents are already indexed withdescriptors. Regarding to degree of satisfaction, five information sourceswere evaluated by eight librarians and seven users who considered Scopusthe best information source followed by Web of Science, PubMed, LILACSand SciELO.
Subject(s)
Humans , Databases, Bibliographic , Information Storage and RetrievalABSTRACT
RESUMEN Objetivo Este estudio tiene como objetivos 1) crear conciencia del volumen de información en salud existente en la web de calidad, 2) explorar la percepción de profesionales de la información con relación al uso de fuentes cualificadas en la toma de decisiones en salud, y 3) presentar recomendaciones que permitan fortalecer las capacidades de los trabajadores de la salud y las competencias institucionales relacionadas con la alfabetización digital. Métodos Se realizó un estudio no experimental descriptivo transversal con una muestra no probabilística de 32 profesionales de la información de nueve países. Se recopiló información de internet sobre el volumen de contenidos existentes en herramientas web, redes sociales y fuentes de información en salud. Se realizaron búsquedas en inglés y en español utilizando las palabras clave Ebola, Zika, Dengue, Chikungunya, Safe food, Health equity, Safe sex, y Obesit. Por último, se obtuvo información sobre la oferta de formación formal en temas de alfabetización digital, gestión de información y otros relacionados. Resultados Seleccionando sólo cuatro enfermedades de alto impacto en salud pública en mayo de 2016 y promediando un tiempo de revisión mínimo de cada producto de información, se tardaría más de 50 años seguidos sin dormir para consultar todo lo publicado en línea sobre Dengue, Zika, Ebola y Chikungunja. Conclusión Se concluye que la salud pública se beneficiaría con instituciones de salud que implementaran estrategias formales de gestión del conocimiento, con instituciones académicas de ciencias de la salud que incorporaran programas formales de alfabetización digital y con trabajadores de la salud cuyo desarrollo profesional sea responsable y funcional en la sociedad de la información.
ABSTRACT Objective The objectives of this study were to: 1) raise awareness of the volume of quality health information on the Internet; 2) explore perceptions of information professionals with regard to the use of qualified sources for health decision-making; and 3) make recommendations that facilitate strengthening health worker capacities and institutional competencies related to digital literacy. Methods A non-experimental, descriptive cross-sectional study was conducted with a non-probability sample of 32 information professionals from nine countries. Internet information was compiled on the volume of content in Internet tools, social networks, and health information sources. Searches in English and Spanish were carried out using the keywords Ebola, Zika, dengue, chikungunya, safe food, health equity, safe sex, and obesity. Finally, information was obtained on opportunities for formal education on the subjects of digital literacy, information management, and other related topics. Results Selecting only four diseases with a high impact on public health in May 2016 and averaging minimum review time for each information product, it would take more than 50 years without sleeping to consult everything that is published online about dengue, Zika, Ebola, and chikungunya. Conclusion We conclude that public health would benefit from: health institutions implementing formal knowledge management strategies; academic health sciences institutions incorporating formal digital literacy programs; and having health workers who are professionally responsible and functional in the information society.
RESUMO Objetivos 1) Conscientizar sobre o volume de informação em saúde de qualidade existente na internet, 2) explorar a percepção dos profissionais da informação sobre o uso de fontes qualificadas na tomada de decisão em saúde e 3) fazer recomendações para reforçar o preparo dos profissionais de saúde e as competências institucionais quanto à alfabetização digital. Métodos Foi realizado estudo transversal descritivo não experimental em uma amostra não probabilística com 32 profissionais da informação de nove países. Foi coletada informação da internet sobre o volume de conteúdos existentes sobre ferramentas de internet, redes sociais e fontes de informação em saúde. Foram realizadas buscas em inglês e espanhol utilizando as palavras-chave Ebola, Zika, Dengue, Chikungunya, Safe food, Health equity, Safe sex, e Obesity. E foi obtida informação sobre a oferta de cursos de formação em alfabetização digital, gestão da informação e outros tópicos relacionados. Resultados Com a seleção de apenas quatro doenças de alto impacto em saúde pública em maio de 2016, com tempo de revisão médio mínimo para cada produto de informação, seriam necessários mais de 50 anos contínuos, sem intervalo para dormir, para consultar todo o conteúdo publicado online sobre dengue, zika, Ebola e chikungunya. Conclusão Conclui-se que existiria benefício para a saúde pública se as instituições de saúde implementassem estratégias formais de gestão do conhecimento, as instituições acadêmicas de ciências da saúde incorporassem programas formais de alfabetização digital e os profissionais de saúde investissem em desenvolvimento profissional responsável e prático na sociedade da informação.
Subject(s)
Information Management , Information Management/organization & administration , Health CommunicationABSTRACT
OBJETIVOS: definir estratégias para persistir dados em conformidade com arquétipos. Um arquétipo combina elementos do Modelo de Referência (MR) para definir conceitos por meio das informações correspondentes, e o padrão openEHR não fornece uma proposta de persistência de dados baseada em grafos de objetos do MR. MÉTODOS: A persistência é baseada exclusivamente nas classes do MR, ou seja, é aplicável a todo e qualquer arquétipo. As estratégias são definidas com base na geração de esquemas de dados para as classes do MR. Nesse texto é ilustrado o emprego para o Pacote Identificação do openEHR. RESULTADOS: são geradas cinco alternativas de modelos de dados para o Pacote Identificação. CONCLUSÃO: a escolha de uma estratégia para persistir dados baseados no MR do openEHR deve considerar o tempo de consulta e o espaço de armazenamento disponível.
OBJECTIVES: to define strategies in order to persist data in conformance with archetypes. An archetype combines Reference Model (RM) elements to define concepts through the appropriate information, and openEHR standard does not provide a proposal for data persistence based on MR objects graphs. METHODS: Persistence is performed from the classes of MR, ie, is adequate for each and every archetype. The strategies are applied in data schemes generation for classes of openEHR Identification Package. RESULTS: Five alternatives data models are generated for the openEHR Identification Package. CONCLUSION: The choice of a strategy to persist data based on MR of openEHR shall consider query execution time and available storage.
Subject(s)
Humans , Information Storage and Retrieval , Electronic Health Records , Health Information Systems , Congresses as TopicABSTRACT
Sistemas de Informação em Saúde persistem Registros Eletrônicos de Saúde a partir da definição de como os dados devem ser armazenados e recuperados. Devido ao desenvolvimento de estratégias que empregam a separação entre informação e conhecimento (modelagem multinível), faz-se necessário explorar pesquisas relacionadas à persistência de dados. OBJETIVOS: Investigar o estado da arte referente ao armazenamento e recuperação de dados clínicos baseados na modelagem multinível. MÉTODOS: Revisão sistemática da literatura, envolvendo: requisitos de qualidade para persistência, mapeamento de modelos de banco de dados, descrição e avaliação da camada de persistência e detalhamento de benchmarks. RESULTADOS: De 843 artigos encontrados, 45 foram incluídos, mas apenas 20 apresentaram dados relevantes. CONCLUSÃO: Em geral, o desenvolvimento de sistemas de saúde multiníveis é orientado por requisitos de desempenho e espaço, contudo as avaliações são centradas no desempenho de consultas. Poucos estudos apresentam estratégias de mapeamento de banco de dados e benchmarks significantes.
Health Information Systems persist Electronic Health Records according to the definition of how data must be stored and retrieved. Due to the development of strategies that employ the separation between information and knowledge (multilevel modeling), it is necessary to explore researches related to data persistence. OBJECTIVES: To investigate the state of the art related to the storage and retrieval of clinical data based on multilevel modeling. METHODS: Systematic review of the literature, involving: quality requirements for persistence, database model mapping, description and evaluation of the persistence service and benchmark detailing. RESULTS: From 843 papers found, 45 were included, but only 20 presented relevant data. CONCLUSION: In general, the development of multilevel health systems is driven by performance and space requirements, however evaluations are focused on queries performance. Few studies present significant benchmarks and strategies for database mapping.
Subject(s)
Humans , Information Storage and Retrieval , Electronic Health Records , Health Information Systems , Congresses as TopicABSTRACT
OBJETIVO: esta revisão sistemática tem como objetivo identificar como o armazenamento de dados tem sido realizado em sistemas de RES (Registro Eletrônico de Saúde). MÉTODOS: Seguindo a metodologia de revisão sistemática com meta-análise, os autores revisaram artigos publicados entre 2000 e 2015 nas bases de dados PubMed, IEEE e ScienceDirect, que descrevem o armazenamento de RES. Além disso, uma análise de conteúdo indutivo foi realizada para sumarizar os passos e metodologias seguidos a fim de construir sistemas de RES. RESULTADOS: 633 artigos foram selecionados inicialmente, 79 foram selecionados para a análise completa e 32 foram eleitos para revisão final. Estes artigos eleitos foram analisados para extrair informações relevantes sobre armazenamento de RES. Foi observado, por meio dos artigos revisados, de que não há nenhuma maneira padrão e comum adotada para o armazenamento de RES. CONCLUSÃO: Há pouca informação disponível sobre armazenamento de RES, sugerindo oportunidades no sentido de se conceber uma metodologia de boas práticas para o armazenamento e a recuperação de RES.
OBJECTIVE: this systematic review aims to identify how data storage has been achieved in Electronic Health Record (EHR) systems. METHODS: Following meta-analysis systematic review methodology, the authors reviewed papers published between 2000 and 2015 in PubMed, IEEE and ScienceDirect databases, which describes the storage of EHRs. Additionally, an inductive content analysis was performed to summarize the steps and methodologies followed in order to build EHR systems. RESULTS: 633 articles were screened, 79 were selected for the full review and 32 have been elected for final review. These articles elected were analyzed to extract relevant information about EHR storage. It has been noticed through the reviewed articles that there is no standard and common way adopted for EHR storage. CONCLUSION: There is little available information about EHR storage, suggesting opportunities in the sense of design a methodology for best practices for EHR storage and retrieval.
Subject(s)
Humans , Information Storage and Retrieval , Electronic Health Records , Congresses as TopicABSTRACT
OBJETIVO: Identificar o estado da arte com relação à aplicação de recuperação de vídeos baseada em conteúdo no contexto de vídeos médicos. Nossa contribuição é fornecer uma visão geral sobre estudos anteriores, bem como vantagens e desafios a serem explorados no tema por pesquisadores da área de aplicações de informática em saúde. MÉTODOS: Nós conduzimos uma revisão sistemática nas principais bases de trabalhos científicos das áreas da computação e medicina. Depois de definir um protocolo, nós conduzimos uma busca por artigos e tecemos uma discussão crítica sobre os estudos encontrados. RESULTADOS: Os resultados mostraram que a aplicação do conceito de recuperação de vídeos baseada em conteúdo na área médica é recente e ainda pouco explorada. CONCLUSÕES: Nos trabalhos analisados, as aplicações de interesse consistem na identificação e descrição de estruturas representadas nos vídeos para posterior indexação e recuperação. Os objetivos mais comuns verificados são auxílio ao diagnóstico, análise de procedimentos e tomada de decisão.
OBJECTIVE: Identify the state of the art about the application of content-based video retrieval in the context ofmedical videos. Our contribution is to provide an overview of previous studies as well as advantages and challenges tobe explored on this subject to the researchers interested in the applied health informatics field. METHODS: We conducta systematic review in the main scientific databases of the computing and medical fields. After defining a protocol, we conducted a search and, then, a critical discussion about the studies. RESULTS: The results showed that the application of the concept of content-based video retrieval in the medical field is recent and has been little explored. CONCLUSIONS: Applications of interest in the analyzed works consist in the identification and description of structures depicted in thevideos for later indexing and retrieval. The most common goals are to aid diagnosis, procedures analysis, and decision making.
Subject(s)
Humans , Medical Informatics Applications , Information Storage and Retrieval , Diagnosis, Computer-Assisted , Audiovisual Aids , Congresses as TopicABSTRACT
O interesse pelo constructo qualidade de vida tem aumentado paralelamente ao número de instrumentos para mensurá-lo. Com o objetivo de analisar a produção científica sobre a temática, o que permitirá uma reflexão sobre este constructo em nosso país, foi realizada uma revisão sistemática no banco de dados SciELO, de janeiro de 2001 a dezembro de 2006, sendo desenvolvido em três etapas: a primeira com 180 publicações, a segunda com 124, e a terceira com 10. Das 180 publicações 77,4 por cento constitui-se da produção nos últimos três anos, com crescimento de 32,4 por cento de 2001 para 2006. Destas, 124 foram selecionados para análise metodológica, de acordo com a categoria do estudo: 79 (63,9 por cento) artigos de aplicação de instrumento; 25 (20,1 por cento) tradução e validação, adaptação e construção de instrumento de QV; 10 (8 por cento) estudos qualitativos acerca da QV; 5 (4 por cento) revisão bibliográfica; 5 (4 por cento) sobre o conceito de qualidade de vida. Nesta etapa, observou-se a utilização de questionários e/ou roteiros para entrevista de forma a se obter dos entrevistados uma concepção mais ampla da qualidade de vida percebida. Conclui-se que houve uma produção científica relevante no período estudado, com diversificação de abordagens e metodologias, privilegiando a complexidade dessa temática.
Interest in the quality of life construct has increased in the same proportion as the output of instruments to measure it. In order to analyze the scientific literature on the subject to provide a reflection on this construct in Brazil, a systematic review of the SciELO database covering the period from January 2001 to December 2006 was conducted. It was divided into 3 phases: the first involving 180 publications, the second 124, and the third 10. Of the 180 publications, 77.4 percent consisted of production in the last three years, with growth of 32.4 percent from 2001 to 2006. Of these, 124 were selected for methodological analysis in accordance with the category of the study: 79 (63.9 percent) instrument application articles; 25 (20.1 percent) translation, validation, adaptation and construction of a QOL instrument; 10 (8 percent) qualitative studies on QOL; 5 (4 percent) bibliographical review, 5 (4 percent) on the quality of life concept. The next stage involved the use of questionnaires and/or interview scripts in order to obtain a broader consensus on perceived quality of life from the interviewees. It was seen that there was significant scientific output in the period under scrutiny, with diversification of approaches and methodologies, highlighting the complexity of the quality of life construct.
Subject(s)
Quality of Life , Abstracting and Indexing , Databases, BibliographicABSTRACT
OBJETIVO: Elaborar una ecuación de búsqueda que permita recuperar la producción científica académico institucional brasileña, aplicada al tema de la actividad física. MÉTODOS: La ecuación de búsqueda consistió en la unión booleana del descriptor ®ejercicio¼ asociado por el booleano AND, al nombre de las distintas instituciones académicas asociadas, a su vez, mediante el conector OR. La búsqueda en MEDLINE, a través de PubMed se realizó el 16/11/2008. Las instituciones se seleccionaron según la clasificación de Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) para los convenios interuniversitarios. RESULTADOS: Se recuperó un total de 407 referencias, de las cuales, 0,9 por ciento era sobre ejercicio y el 0,5 por ciento de producción científica académica brasileña, indexadas en MEDLINE, en la fecha de la consulta. Al comparar con la revisión manual efectuada, la ecuación de búsqueda (descriptor + filtro institucional) manifestó una sensibilidad del 99 por ciento y una especificidad del 100 por ciento. CONCLUSIONES: El filtro académico institucional presentó alta sensibilidad y especificidad, que es a su vez aplicable a otras áreas del conocimiento relacionadas con las ciencias de la salud. Sería conveniente que las instituciones académicas establecieran su "nombre/marca" con el fin de poder rescatar de forma eficiente su literatura científica.
Subject(s)
Access to Information , Information Storage and Retrieval , Motor Activity , Bibliometrics , Subject Headings , ExerciseABSTRACT
A maior parte da informação médica em forma digital se encontra na forma de textos livres como nos sites de medicina e saúde, artigos científicos em banco de dados da literatura biomédica e em prontuários eletrônicos do paciente (PEP). Muitos problemas podem ocorrer em sistemas de recuperação de informações médicas como o uso de sinonímia, erros de digitação e variações semânticas na linguagem médica. Para analisar a quantidade de informações que são perdidas em sistemas de busca tradicionais, que fazem um busca do termo exato, foram selecionados 34 termos médicos de duas bases de dados de PEPs e pesquisados com um algoritmo tradicional de busca direta embutido em um PEP chamado Clinic ManagerÒ e um sistema desenvolvido batizado SIRIMED que embutiu algoritmos de semelhança semântica (incorporação de sinônimos) e semelhança ortográfica (edit distance+stemming).Os resultados mostram que a recuperação dos termos aumenta em cerca de 30% em relação à busca tradicional, com uma quantidade de falsos positivos baixa (menos de 1%), o que mostra que muitas informações são perdidas normalmente.
Most medical information in digital form occurs in internet health sites, biomedical literature databases and electronic patient record (EPR). Many problems can be found in medical information retrieval systems like problems of synonyms, mistakes on typing and semantic variations in medical language. To analyse the amount of lost infomation in traditional information retrieval systems which use exact string matching, 34 medical terms were selected from two databases of EPRs and they were analysed with traditional search found in EPR System called Clinic Manager and a new system called Sirimed developed by autor which was added algorithms to semantic approximate (synonymous) and approximate string matching (edit distance + stemming). The results show that information retrieval was improved in 30% in compare with the traditional search, with little amopunt of false positives (less 1%), that show a lot of lost informations.
Subject(s)
Information Storage and Retrieval , Abstracting and Indexing/methods , Semantics , Information Services , Medical Records Systems, ComputerizedABSTRACT
Este artigo teve como objetivo realizar uma revisão da literatura sobre a técnica de mineração de dados (Data Mining - DM) nas bases de dados abrangendo o Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde (LILACS), Scientific Eletronic Library Online (SCIELO) e alguns livros sobre o tema. Buscou-se uma coleta ampla utilizando as palavras data mining e mineração de dados, abrangendo o período de 1999 a 2008. Como critérios de exclusão foram utilizados os descritores: indústria mineira, minas, mineralogia; foram excluídos artigos que não esclareciam o método e as tarefas relacionadas à mineração de dados. Dos 123 artigos encontrados, 32 foram selecionados. Observou-se que o volume de dados armazenados é gigantesco e continua crescendo exponencialmente. Com isso o processo de Descoberta do Conhecimento em Bases de Dados e DM inclui tarefas e métodos para extração de conhecimento útil, interessante e indispensável na tomada de decisões rápidas nas mais diversas áreas de conhecimento.
The purpose of this study was to conduct a literature review on data mining (DM) technique in the LILACS and SciELO databases and specialized books. A broad data literature search using the words data mining (in English) and/or "mineração de dados" (in Portuguese) and limited to publications between 1999 and 2008, was conducted. The exclusion criteria were the keywords mining industry, mines, mineralogy, and publications that did not describe the methods and the tasks related to data mining. Of 123 publications retrieved, 38 were selected to review. Findings suggest that the existent amount of stored data is titanic and it continue to increase considerably. Thus, the process of knowledge discovery in databases and DM have developed tasks and methods for the retrieval of useful knowledge that may be of interest and necessary for just-in-time decision making in different areas of knowledge.
En este artículo se tuvo como objetivo realizar una revisión de la literatura sobre la técnica de mineración de datos (Data Mining - DM) en las bases de datos que abarcaban la Literatura Latino-Americana y del Caribe en Ciencias de la Salud (LILACS), Scientific Eletronic Library Online (SCIELO) y algunos libros sobre el tema. Se buscó una recolección amplia utilizando las palabras data mining y mineración de datos, en el período comprendido entre 1999 a 2008. Como criterios de exclusión fueron utilizados los descriptores: industria minera, minas, mineralogía; se excluyeron artículos que no aclaraban el método y las tareas relacionadas a la mineración de dados. De los 123 artículos encontrados, 32 fueron seleccionados. Se observó que el volumen de datos almacenados es gigantesco y continúa creciendo exponencialmente. Con eso el proceso de Descubrimiento del Conocimiento en Bases de Datos y DM incluye tareas y métodos para la extracción del conocimiento útil, interesante e indispensable para la toma de decisiones rápidas en las más diversas áreas del conocimiento.